Wraz z meteorytem na Ziemię przybyli kosmici, jednakże stosunkowo szybko zostali pokonani. Tak przynajmniej się wszystkim wydawało do momentu, w którym wrócili ze zdwojoną siłą. Jeden z takich ataków przeżył sześcioletni Hayato Kisaragi, zdołał także uratować swoją ukochaną przed niechybną śmiercią ze strony kosmitów. Niestety, w wyniku niefortunnego zbiegu okoliczności stracił pamięć. 10 lat po tych wydarzeniach Hayato dostaje się do Bugeiki - elitarnej szkoły stworzonej do walki z kosmitami. Liczy on, że może w tej sławnej akademii pomogą mu odzyskać cenne wspomnienia.
