Als het jaar 3000 nadert, wordt een door oorlog verscheurd zonnestelsel binnengevallen door de Keizerlijke Alliantie op zoek naar een opperwezen, de F-01. Het experimentele X Bomber-ruimtevaartuig met zijn jonge bemanning moet het geheim van F-01 ontdekken en het tegen de Keizerlijke Alliantie keren, anders is alles verloren.
