第2話 神との対決 / Who Mourns for Adonais?フォルクス4号星の近くで、エンタープライズ号は緑の巨大な手に捕まり、強制的に着陸させられる。そこでカークたちはギリシャ神話の神、アポロと名乗る男に遭遇する。アポロは彼らをこの星に永住させようとする。しかし、カークにはある考えがあった。
第3話 超小型宇宙船ノーマッドの謎 / The Changeling
第3話
第3話 超小型宇宙船ノーマッドの謎 / The Changeling人間ほどの小さな宇宙船がエンタープライズ号に侵入してきた。言葉を語るこの宇宙船が言うには、自分のコンピューターには“不完全なるもの”を根絶せよとの指令を受けているという。もちろん、人間も含まれる。しかし、船長のカークという名前を聞くや、なぜか“あなたは私の設計者”だと言い出し、危害を加えなくなった。
第5話 死のパラダイス / The Appleカーク等は宇宙のパラダイスと呼ばれる惑星ガンマー6号に上陸、探検を始めた。一面美しい森におおわれた中に住民がいるというのだ。だが、一行が森の中を行くうちに、花が毒のめしべをとばしたり、あるいは電光によって隊員たちが次々に死んでいった。ガンマー6号は死のパラダイスとなった。
第6話 宇宙の巨大怪獣 / The Doomsday Machine
第6話
第6話 宇宙の巨大怪獣 / The Doomsday Machineエンタープライズ号は遭難信号をキャッチするが、急行したL370太陽系は何者かに破壊されて、破片だけが宇宙に漂っていた。多くの惑星を粉々に破壊する恐るべき犯人は果たして何者なのか。やがて前方に、同僚のパトロール船コンステレーション号が操縦不能となって漂っているのを発見。カークたちが調査に向かって、船長のデッカー准将を収容する。デッカーの話では、犯人は巨大な怪物だったという。
第7話 惑星パイラスセブンの怪 / Catspaw
第7話
第7話 惑星パイラスセブンの怪 / CatspawTwo powerful aliens threaten the well-being of the Enterprise and her crew.
第8話 不思議の宇宙のアリス / I, Mudd
第8話
第8話 不思議の宇宙のアリス / I, MuddCaptain Kirk has a second run-in with the conman, Harry Mudd. Mudd is now the supreme ruler of a planet of androids who cater to his every whim.
第9話 華麗なる変身 / Metamorphosis
第9話
第9話 華麗なる変身 / MetamorphosisA shuttle crew from the USS Enterprise encounters a man out of history and his mysterious alien companion.
第10話 惑星オリオンの侵略 / Journey to Babel
第10話
第10話 惑星オリオンの侵略 / Journey to BabelThe Enterprise must transport dignitaries to a peace conference, with an assassin on the loose.
第11話 宿敵クリンゴンの出現 / Friday's Child
第11話
第11話 宿敵クリンゴンの出現 / Friday's ChildThe Federation clashes with the Klingon Empire over mining rights to Capella IV. A sudden coup between its warrior-minded inhabitants forces Kirk's party to flee with the now dead leader's pregnant wife.
第12話 死の宇宙病 / The Deadly Years
第12話
第12話 死の宇宙病 / The Deadly YearsStrange radiation exposes the command crew of the Enterprise to the effects of rapid aging.
第13話 復讐! ガス怪獣 / Obsession
第13話
第13話 復讐! ガス怪獣 / ObsessionCaptain James T. Kirk becomes obsessed with destroying a deadly entity he once encountered in his youth.
第14話 惑星アルギリスの殺人鬼 / Wolf in the Fold
第14話
第14話 惑星アルギリスの殺人鬼 / Wolf in the FoldA series of bizarre murders points to Mr. Scott as the prime suspect.
第15話 新種クアドトリティケール / The Trouble with Tribbles
第15話
第15話 新種クアドトリティケール / The Trouble with Tribblesクリンゴン帝国との紛争の絶えない宙域にある宇宙ステーションK7に接近するエンタープライズ。シャーマン惑星だけで育てられる穀物クアドトリティケールをクリンゴンから護衛するために呼び出されたのだ。ところが、珍動物トリブルが繁殖し、この穀物を食べてしまう。
第16話 宇宙指令! 首輪じめ / The Gamesters of Triskelion
第16話
第16話 宇宙指令! 首輪じめ / The Gamesters of Triskelionエンタープライズは無人惑星ガンマ2に接近し、装備点検のためにカーク、ウラ、チェコフの3名が上陸しようとした時、突如姿を消してしまった。残ったスポックたちは、ガンマ2を捜索するが発見できない。一方、当のカークたちは、見馴れぬ惑星上に投げ出され、惑星人たちに襲われて、捕虜となっていた。
第17話 宇宙犯罪シンジケート / A Piece of the Action
第17話
第17話 宇宙犯罪シンジケート / A Piece of the Action惑星シグマ・イオタ2は、百年前に地球連邦のパトロール船ホライズン号が飛来して、文明に影響を与えていったことが判明したため、カークたちはその結果を調査しに訪れる。今や他の惑星の内政不干渉主義を決定した地球連邦としては、ホライズン号が好ましくない影響を与えていたとしたら、それを修正する義務があるのだ。
第18話 単細胞物体との衝突 / The Immunity Syndrome
第18話
第18話 単細胞物体との衝突 / The Immunity Syndromeエンタープライズ号は休養をとるため、第6宇宙基地へ向かっていた。その途中、本艦隊から僚船イントレピッド号の救援に向かえとの命令を受けた。同号が音信を絶ったというのである。現場へ急行したエンタープライズ号は、そこで得体の知れぬ怪獣に遭遇する。
第19話 カヌーソ・ノナの魔力 / A Private Little War
第19話
第19話 カヌーソ・ノナの魔力 / A Private Little Warクリンゴンとの不干渉協定を結んだ未開の惑星を13年ぶりに訪れたカークは、昔平和に暮らしていた山と村の部落がお互いに戦っていることに驚く。船に戻ったカークは付近にクリンゴン船もいると知って、住民に銃を与えたのは彼らの仕業とにらんで、マッコイと共に再び調査に赴くが……。
第20話 地底160キロのエネルギー / Return to Tomorrow
第20話
第20話 地底160キロのエネルギー / Return to Tomorrowある惑星から発信された遭難信号を受信したエンタープライズは急行するが、不思議なことにそれは電波ではなく、また惑星上には何ら生命が存在しないことを知って驚く。この惑星は、50万年昔に激変が起こり、それ以来不毛の地と化していた。やがてスポックの探知器に、地下160キロの岩の中に強烈なエネルギー源があることが写し出される。
第21話 エコス・ナチスの恐怖 / Patterns of Force
第21話
第21話 エコス・ナチスの恐怖 / Patterns of Force宇宙の一角に存在するゼオンとエコス星に接近したカークたちは、地球連邦の著名な歴史家、ジョン・ギルに連絡するが応答がない。実はジョン・ギルは、エコス星の文明発展を見守るオブザーバーとして、連邦から秘かに派遣されていたのだが、急に連絡が途絶えたのだった。
第22話 宇宙300年の旅 / By Any Other Name
第22話
第22話 宇宙300年の旅 / By Any Other Nameエンタープライズはある惑星から発信された遭難信号をキャッチし、現場へ急行した。だが惑星に待ち構えていたのは、アンドロメダ銀河系から来たケルバ星人たちだった。彼らの宇宙船が難破したため、エンタープライズをおびき寄せて乗っ取ろうとしたのだ。
第23話 細菌戦争の果て / The Omega Glory
第23話
第23話 細菌戦争の果て / The Omega Glory惑星オメガ4へ接近したエンタープライズは、周回軌道上に地球連邦のパトロール船エクセター号がいることを発見する。調査に赴いたカークたちは、エクセター内で恐ろしいものを見た。乗組員が全員小さな白い結晶となり果て、ユニフォームだけを残して死んでいたのだ。これは何者の成せる業なのか？
第24話 恐怖のコンピューターM-5 / The Ultimate Computer
第24話
第24話 恐怖のコンピューターM-5 / The Ultimate Computer宇宙ステーションから緊急連絡を受け急行したエンタープライズは、驚くべき任務を命ぜられて関係者一同あ然となる。天才ディストロム博士の新発明、M5コンピューターをエンタープライズにセットし、乗組員はカーク船長以下わずか20名で、M5のコントロールによるテスト飛行を行うというのだ。
第25話 もう一つの地球 / Bread and Circuses
第25話
第25話 もう一つの地球 / Bread and Circusesメリック船長の宇宙艇ビーグル号は、6年前に惑星4号の観測に向かったきり行方不明になっていた。エンタープライズ号が惑星4号に接近した時、その宇宙艇の残骸が浮遊しているのを発見した。宇宙艇がいん石に衝突し、航行不能に陥ってから、惑星4号に上陸したという可能性が考えられた。カーク船長ら3名は惑星4号に上陸し、驚くべき事実を知る。
